كيفية فتح وتحرير وتحويل ملفات PDB
من الأرجح أن يكون ملفًا بامتداد ملف PDB ملفًا تم إنشاؤه بتنسيق قاعدة البيانات الذي يتم استخدامه لإجراء معلومات تصحيح الأخطاء حول برنامج أو وحدة نمطية ، مثل ملف DLL أو EXE . انهم في بعض الأحيان تسمى ملفات الرموز.
تقوم ملفات PDB بتخطيط المكونات والعبارات المختلفة في التعليمة البرمجية المصدر إلى منتجها النهائي المترجم ، والذي يمكن أن يستخدمه مصحح الأخطاء للبحث عن الملف المصدر والموقع في الملف التنفيذي الذي يجب عليه إيقاف عملية تصحيح الأخطاء فيه.
قد تكون بعض ملفات PDB بدلاً من ذلك في تنسيق ملف بنك معلومات البروتين. ملفات PDB هذه هي ملفات نصية بسيطة تخزن الإحداثيات المتعلقة بهياكل البروتين.
ربما يتم إنشاء ملفات PDB الأخرى في تنسيق Palm Palm أو تنسيق ملف PalmDOC واستخدامها مع نظام التشغيل PalmOS المحمول. بعض الملفات في هذا التنسيق تستخدم ملحق الملف .PRC بدلاً من ذلك.
كيفية فتح ملف PDB
تستخدم البرامج المختلفة ملف PDB الخاص بها لتخزين البيانات في نوع معين من تنسيق قواعد البيانات المنظمة ، بحيث يتم استخدام كل تطبيق لفتح نوع ملف PDB الخاص به. تعتبر Geneious و Intuit Quicken و Microsoft Visual Studio و Pegasus مجرد أمثلة قليلة من البرامج التي قد تستخدم ملف PDB كملف قاعدة بيانات. قد يعمل Radare و PDBparse على فتح ملفات PDB أيضًا.
يتم تخزين بعض ملفات PDB كنص عادي ، مثل ملفات قاعدة بيانات Debe لبرنامج Geneious ، وتكون قابلة للقراءة بشكل كامل إذا تم فتحها في محرر نصوص. يمكنك فتح هذا النوع من ملف PDB مع أي برنامج يمكنه قراءة المستندات النصية ، مثل برنامج "المفكرة" المدمج في Windows. تتضمن بعض برامج تحرير وملفات برامج PDB برامج Notepad ++ و Brackets.
ملفات قاعدة بيانات PDB الأخرى ليست مستندات نصية ولا تكون مفيدة إلا عند فتحها مع البرنامج المخصص لها. على سبيل المثال ، إذا كان ملف PDB مرتبطًا بطريقة ما بطريقة Quicken ، فحاول استخدام هذا البرنامج لعرض ملف PDB أو تحريره. يتوقع Visual Studio مشاهدة ملف PDB في نفس المجلد مثل ملف DLL أو EXE.
يمكنك عرض وتعديل ملفات PDB التي هي ملفات بنك Protein Data ، في Windows و Linux و MacOS مع Avogadro. بإمكان Jmol و RasMol و QuickPDB و USCF Chimera فتح ملف PDB أيضًا. نظرًا لأن هذه الملفات هي نص عادي ، يمكنك فتح ملف PDB في محرر نصوص أيضًا.
يجب أن يكون Palm Desktop قادراً على فتح ملفات PDB الموجودة في تنسيق ملف قاعدة البيانات Palm ، ولكن قد تضطر إلى إعادة تسميتها أولاً حتى يكون لديك امتداد الملف .PRC لهذا البرنامج ليتعرف عليه. لفتح ملف PalmDOC PDB ، جرب STDU Viewer.
كيفية تحويل ملف PDB
من المحتمل ألا يتم تحويل ملفات قاعدة بيانات البرامج إلى تنسيق ملف مختلف ، على الأقل ليس باستخدام أداة تحويل ملفات عادية . بدلاً من ذلك ، إذا كان هناك أي أداة يمكنها تحويل هذا النوع من ملف PDB ، فستكون نفس البرنامج الذي يمكنه فتحه.
على سبيل المثال ، إذا كنت بحاجة إلى تحويل ملف قاعدة بيانات PDB من Quicken ، فحاول استخدام هذا البرنامج للقيام بذلك. على الرغم من ذلك ، فإن هذا النوع من التحويل ربما لا يكون قليل الاستخدام ولكن أيضًا غير مدعوم في تطبيقات قواعد البيانات هذه (على الأرجح أنك لست بحاجة إلى تحويل هذا النوع من ملفات PDB إلى أي تنسيق آخر).
يمكن تحويل ملفات بنك معلومات البروتين إلى تنسيقات أخرى باستخدام MeshLab. للقيام بذلك ، قد يلزم أولاً تحويل ملف PDB إلى WRL باستخدام PyMOL من القائمة File> Save Image As> VRML ، ثم استيراد ملف WRL في MeshLab واستخدام القائمة File> Export Mesh As لتحويل PDB في النهاية الملف إلى STL أو تنسيق ملف آخر.
إذا لم تكن بحاجة إلى أن يكون اللون ملائماً ، فيمكنك تصدير ملف PDB مباشرة إلى STL باستخدام USCF Chimera (رابط التنزيل أعلاه). خلاف ذلك ، يمكنك استخدام نفس الطريقة المذكورة أعلاه (مع MeshLab) لتحويل PDB إلى WRL مع USCF Chimera ومن ثم تصدير ملف WRL إلى STL باستخدام MeshLab.
لتحويل PDB إلى PDF أو EPUB ، إذا كان لديك ملف PalmDOC ، فمن الممكن عدد من الطرق ولكن من الأسهل استخدام محول PDB عبر الإنترنت مثل Zamzar . يمكنك تحميل ملف PDB الخاص بك إلى موقع الويب هذا للحصول على خيار تحويله إلى هذه التنسيقات بالإضافة إلى ملفات AZW3 و FB2 و MOBI و PML و PRC و TXT وغيرها من تنسيقات eBook.
يمكن أن يتم تحويل ملف PDB إلى تنسيق FASTA مع محول MeBab Lab Meiler على الإنترنت إلى محول FASTA.
من الممكن أيضًا تحويل PDB إلى CIF (تنسيق المعلومات البلورية) عبر الإنترنت باستخدام PDBx / mmCIF.
القراءة المتقدمة على ملفات PDB
يمكنك قراءة المزيد حول ملفات قاعدة بيانات البرامج من Microsoft و GitHub و Wintellect.
هناك المزيد لمعرفة المزيد عن ملفات بنك معلومات البروتين أيضًا ؛ راجع Worldwide Protein Data Bank و RCSB PDB.
هل ملفك لا يزال غير مفتوح؟
قد لا تكون ملفات PDB التي لا يتم فتحها باستخدام أيٍّ من الأدوات الواردة أعلاه ملفات PDB فعلاً. ما قد يحدث هو أنك تخطئ في قراءة امتداد الملف ؛ تستخدم بعض تنسيقات الملفات لاحقة تشبه إلى حد كبير ".PDB" عندما تكون غير مرتبطة ولا تعمل بنفس الطريقة.
على سبيل المثال ، ملف PDF هو ملف مستند ولكن معظم البرامج من أعلى لن يعرض النص و / أو الصور بشكل صحيح إذا حاولت فتح أحد هذه البرامج. وينطبق الشيء نفسه على الملفات الأخرى ذات امتدادات الملفات الهجينة المماثلة ، مثل PD و PDE و PDC و PDO.
PBD هو برنامج آخر ينتمي إلى برنامج EaseUS Todo Backup ، لذا فهو مفيد فقط عند فتحه باستخدام هذا البرنامج.
إذا لم يكن لديك ملف PDB ، فابحث عن امتداد الملف الذي يحتوي عليه ملفك بحيث يمكنك العثور على البرنامج المناسب الذي يفتحه أو يحوله.